Една семейна кола трябва да има интелигентни системи за подпомагане на водача, за да се предпази от опасни ситуации. Например Octavia Combi може да се справи със следните ситуации: следи насрещния трафик, когато завивате наляво (при ляв волан) и спира автомобила, ако има опасност. След като сте паркирали колата, тя следи зоната отзад и ви предупреждава, ако има риск да ударите друга кола или велосипедист, докато отваряте вратата.

В случай на инцидент, пътниците са защитени от здрава каросерия с големи зони на смачкване и до 10 въздушни възглавници, осигуряващи фино настроено взаимодействие с триточкови автоматични предпазни колани и безопасни облегалки за глава. Други функции за безопасност включват модерни електронни системи, предназначени да смекчат последствията от инцидент, като спиране при сблъсък и Crew Protect Assist отпред и отзад.

Octavia Combi разполага със системата eCall, която предава информация като местоположението на автомобила, броя на хората в автомобила, позицията на автомобила преди и след инцидента и статуса в случай на инцидент. Може да се активира и ръчно по всяко време чрез бутони в модула на покрива.

Euro NCAP присъди на Škoda Octavia най-високата възможна оценка от пет звезди, като по този начин удостоверява, че автомобилът предлага оптимална защита за всички в него.

В категорията за защита на пътниците Octavia получи резултат от 88 процента от всички възможни точки. Това класира Octavia в горния край на всички тествани автомобили. В категорията за защита на възрастни пътници Octavia отбеляза 92 процента.