В началото на декември 1895 г. механикът Вацлав Лаурин и търговецът на книги Вацлав Клемент, и двамата запалени велосипедисти, започват да произвеждат велосипеди по собствен дизайн, патриотично наречени Славия, в националисткия дух от края на 19в. Няколко години по-късно, през 1899 г., Laurin & Klement Co. започва да произвежда мотоциклети, който скоро стават много успешни и печелят състезания. След първоначалните експерименти на прага на новия век, след 1905 г. производството на мотоциклети постепенно е заменено от автомобили.  

Както и при мотоциклетите, първият автомобил Laurin & Klement - Voiturette A бил абсолютен успех, превърнал се впоследствие в архетипа на чешката автомобилна класика. Скоро той изградил стабилна позиция на компанията в развиващия се международен автомобилен пазар, така че скоро тя можела да започне да работи в по-голям мащаб. Обемът на продукцията се увеличил и скоро надвишил потенциала на едно частно предприятие и през 1907 г. основателите на компанията дали начало на превръщането й в съвместно дружество. Международният характер на дейността на Škoda ставал все по-важен. Производствените съоръжения постоянно били разширявани и след 1914 г. Škoda взема участие в производството за нуждите на въоръжените сили.



Благодарение на икономическото развитие на страната, съдружието със силен индустриален партньор станало необходимо през 20-те години на 20в., за да се засили позицията й и да се модернизира команията, която по това време произвежда многобройни видове пътнически автомобили, камиони, автобуси, самотелни двигатели и земеделски машини. През 1925 г. е постигнато сливане с Pilsen Škoda Co., което отбелязва края на търговската марка Laurin & Klement. В началото на 30-те години автомобилният бизнес отново бил организиран като отделно съвместно дружество в рамките на групата Škoda (Automobile Industry Co., ASAP). След края на кризата компанията постигнала пробив с модела Škoda Popular.
Германската окупация от 1939 до 1945 г. причинила сериозен разрив в историята на компанията, която била интегрирана в промишлената структура на Немската империя. Програмата за гражданско производство незабавно била ограничена и продукцията била ориентирана към нуждите на империята. 
В хода на широкомащабната национализация, която започнала веднага след края на войната, през 1946 г. компанията станала държавно дружество, наречено AZNP. В условията на политическите и икономически промени, протичащи по това време, тя придобила монопол над производството на пътнически автомобили.
Основана на традиоционните производствени процеси и успехите от миналото, чехословашката икономика успяла за задържи един относително висок стандарт в пост/социалистическия период в продължение на няколко десетилетия, въпреки промените, предизвикани от плановата икономика и стремежа към прекомерно бърз растеж. Този стандарт бил поставен под въпрос едва към края на 60-те години, поради развитието на новите технологии в западния свят. Постоянната стагнация на икономиката, започнала след 70-те, засегнала и автомобилния производител от Млада Болеслав, въпреки водещата позиция на комапнията на Източноевропейския пазар. Производството отново нарастнало едва когато започнало производството на модела Škoda Favorit през 1987г.
След политическите промени от 1989 г., при новите икономически условия на пазара Чехословашкото правителство и ръководството на Škoda започнали да търсят силен чуждестранен партньор, чиито опит и инвестиции биха осигурили дългосрочната международна конкурентноспособност на компанията. През декември 1990 г. правителството взело решение за сътрудничество с немския концерн Volkswagen Group. Съместното дружество Škoda – Volkswagen започнало своята дейност на 16 април 1991 г. под името Škoda, automobilová a.s., с което станало четвъртата марка на Volkswagen Group заедно с VW, AUDI и SEAT.